孔胤植担心了两日后，发现清军并没有在曲阜大开杀戒，于是放心了不少，但也就两日，阿巴泰就派人过来借粮。
清军逃进曲阜，把粮食辎重全部落在城外，这两日都是孔胤林拿出粮食供给清军，但孔胤林孔家一个庶出子弟，田地本就不多，要不是做了十多年兖州主事，家中恐怕早就落败。能提供两万清军兵马两日的粮食，已经是孔胤林的极限。
清军说是借粮，但可以肯定，这是有借无还了，这要是胜利之师，孔胤植还有可能会借粮，而如今只是些残兵败将，却想到孔家借粮，这要是被传出去，这衍圣公的名号怕是不会有多光彩。
但形势比人强，建奴的刀就差架在脖子上，不借肯定不行，于是孔胤植冷冷的说：“你们要借多少？”
来借粮的是尚可喜的部将许尔显，许尔显说：“衍圣公，大清有军马两万余，一个月借粮最少得五万石。”
孔胤植立即暴跳起来，说：“一个月一万石，意思是你们还打算不走了是吗？”
许尔显说：“衍圣公，大军不是不走，而是等大清的援军一到，借了多少钱粮，一定会原数奉还。”
“援军，就凭你们蕞尔小邦，能出多少援军才能打败大明天兵，这位将军，本公看你也是大明人，为何还要助纣为虐，本公劝将军不要自误。”
许尔显见孔胤植绝口不提借粮一事，反而有意拉拢自己。可自己投靠大清已经十年，对大明已经是血债累累，在大明叛将中也是榜上有名的，现在想回头怕不会有好果子吃。于是急忙说：“衍圣公，如今不是讨论这个点时候，大清两万大军没有粮草，要是他们做出什么出格的事来，恐怕是不好收拾。”
孔胤植说：“他们不是有两万匹马吗？他们可以杀马充饥，以待援军。”
许尔显说：“衍圣公，大清以马为战，他们把马看的比我们汉人还重，不到万不得已，他们绝对不会杀马。您还是多少借一点粮食给他们，以保曲阜百姓安全。”
孔胤植说：“本公可以借粮一千石给你们，但必须答应本公两件事。”
许尔显听说只借一千石，也就只能支撑个四五天，但有总比没有强，于是就说：“不知衍圣公什么条件？”
孔胤植说：“一，交出孔胤林，二，退出曲阜城。”
许尔显犹豫说：“这…这…恐怕不是末将能够做主的。”
孔胤植说：“你不能做主，就赶紧给本公滚，找一个能够做主的人来。”
许尔显尴尬的说：“衍圣公，末将确实不能做这个主，但大清能做主的，也就不是好相与的，还请衍圣公自重。”
面对许尔显的威胁，孔胤植吓了一跳，但话已经说出口，反悔是绝对不可能，等许尔显离开孔府后，孔胤植不免担心起来。
许尔显回去后向尚可喜禀告，尚可喜无奈，就知道孔家的粮食不好借，但再难借也要去借，许尔显没借到，尚可喜只好亲自出马。
尚可喜本来被阿巴泰打成重伤，连日来又是大战频发，在战时因为精神高度紧张，反而不觉得疼痛，这到了曲阜后，精神松弛下来，才发现伤口并发，又裂开了几道口子。为了不让伤口继续扩大，才派许尔显去孔府。
但许尔显并没有借到粮，尚可喜就算是伤口感染，也要去孔府一趟。
尚可喜到了孔府，苦口婆心的劝说孔胤植，最后孔胤植说：“要粮食可以，也不强求清军退出曲阜，但孔胤林一定要交出来。”
尚可喜肯定不会答应这个要求，而孔胤植却死咬这个条件不松口，为此还给了个十天期限，在这十天之内，孔家一天出一百石粮食。十天之后要是不交出孔胤林，那就对不起。往后别想在孔家要到一两粮食。
面对孔胤植的强硬，尚可喜也没有办法，如今孔家一天能够提供一百石粮食，省省还是可以勉强能够应付一下。
阿巴泰最近有些乐不思蜀，孔胤林为了保命，娇妻美妾都送给阿巴泰享用。尤其是孔胤植的今年新纳的小妾，娇嫩欲滴，吹拉弹唱样样都会，而且酒量还极好。
这天晚上，阿巴泰又被孔胤林请到家中喝酒，小妾借机问阿巴泰：“贝勒爷，等大清的援军一到，贝勒爷打算怎么安置我们老爷？”
阿巴泰醉醺醺的说：“美人，不如等大军来了，你跟我一起回辽东，我封你为侧福晋。到时候荣华富贵，享用不尽。”
小妾说：“贝勒爷，奴家是汉家女，到了辽东，怕是不懂清人规矩，辱没了贝勒爷的名声。奴家还是跟着老爷，贝勒爷什么时候想奴家，随时都可以。”
阿巴泰叹口气说：“美人，如今衍圣公把你家老爷看做眼中钉，死活要本贝勒交出来，不然大军军中就会断粮。眼看只有三日期限，没有粮食，大军恐怕坚持不到援军到达，也许只能委屈一下你家老爷，到衍圣公府去解释清楚。”
小妾连忙说：“贝勒爷万万不可呀，衍圣公对我家老爷恨之入骨，这要到了衍圣公府，那还不得尸骨无存，奴家恐怕也会被衍圣公记恨，到时候，到时候奴家就再也不能伺候贝勒爷了。”
阿巴泰见小妾哭得梨花带雨，猥琐的把小妾搂在怀里说：“放心，有本贝勒在，衍圣公不敢把他怎么样，顶多受点皮肉之苦罢了。”
孔胤林听到小妾的禀告，大惊失色，心想这蛮夷之邦还真不可信，你们不是很能抢吗？为何为了粮食就要陷我与死地，可反抗大清他又不敢。
只有三天时间，那可怎么办？孔胤林也恨衍圣公，自己这些年，为孔家赚了那么多的银子，为了保命才不得已引清军进城，衍圣公不过是拿出一些粮食安抚一下这些匪军不行吗？
孔胤林知道衍圣公有多狠毒，这些年死在衍圣公府的佃户、婢女长工不知有多少？这要是落在衍圣公手里，自己不死都得脱层皮。
于是，孔胤林恨从心边起，恶从胆边生，当晚，孔胤林就召集自己收养的死士。
这些年孔胤林在兖州做孔家的主事，还充当满清细作，收留了不少亡命之徒，当日之所以能够在滋阳逃脱，都亏了这些人杀出一条血路才得以逃脱。
第二天晚上，孔胤林带着三百死士，突然杀进衍圣公府，衍圣公府的这些恶奴，平日里欺男霸女还行，哪里是穷凶极恶的亡命之徒的对手，虽然人数众多，但还是被打了个措手不及。
孔胤林知道，没有孔家，他啥也不是，所以杀到孔家后，就直冲孔胤植的卧房，一刀结果了孔胤植。
衍圣公府巨变当然惊动了巡夜的清军，等清军赶到时，孔家孔胤植一系子弟都被屠杀殆尽。
尚可喜听到消息后也是非常震惊，连忙敢往衍圣公府，看到衍圣公府的惨状，尚可喜心中一慌，说：“完了，全完了。”
尚可喜气得把所有的死士当场赐死，把孔胤临抓起来，带去见阿巴泰。
阿巴泰见事情已经发生，他也不在意，孔胤植一直想要杀了孔胤林这个把妻妾都奉献出来的好奴才，让阿巴泰本来就不喜，觉得孔胤植挑战了大清贝勒的权威。
阿巴泰觉得想孔胤植这样的衍圣公肯定不是大清的好奴才，还不如选一个听话的衍圣公，于是灵机一动，当场就决定让孔胤林继任衍圣公。
孔胤林听了大喜，这要是自己当了衍圣公，自家这一脉就飞黄腾达了，作为孔家人，怎么不知道这嫡庶之分。虽说这衍圣公是阿巴泰所封，做不的数，但只有掌握了孔家巨大的财富，再到朝中收买一些官员，得到大明的册封也不是不可能，当年楚王宫不是也发生过假世子吗？唐王家也有以庶夺嫡的事情发生。而现在衍圣公直系血亲被自己屠戮一空，只要不让世人知道是自己所为，朝廷想要衍圣公延续，自己不是没有机会。
孔家学案发生在深夜，自清军进城以来，就实行了严格的宵禁，所以第二天曲阜百姓并不知道衍圣公府出现了血案。但遗憾的是，孔胤林在孔府虽然搜出大量的金银财宝，但粮食却不多，而掌管孔府府库的是孔家的三长老。
这三长老孔胤禩是孔贞运的大哥之子，孔贞运是孔家少有的进士出身，早些年还做过首辅，在曲阜虽然不是衍圣公嫡系出身，但民望极大。
但在曲阜，名望再大，能够在衍圣公府任一职就属于造化。
这就不得不说这是世袭制的局限性，当年汉武帝实行推恩令，只在皇家内部实行，这确实减少了朝廷负担，也分化了藩王的实力。但推恩令在民间却很难推行，而世袭制确实能够集中财富，有利于提高家族地位，所以在汉朝以后，出现了门阀政治。
晋朝废除推恩令，立即出现八王之乱。到了魏晋南北朝时期，藩王门阀乱做一团，才有了五胡乱华。
推恩令实行的不彻底，主要就是忽略了人权平等，也没有彻底废除世袭制。
但在生产力低下的封建王朝，推恩令已经是开天辟地的大举措。这也是自汉以后，再没有推恩令一说的原因。