阿卡迪亚号上的幸存者们在一场惨烈的战斗中全军覆没，无一幸免。这艘曾经承载着希望与求生欲望的船只，最终成为了他们生命的终点。与此同时，爱丽丝被那家公司——安布雷拉公司——重新捕获，并带到了一个位于地下的秘密模拟城市基地。这个基地是一个巨大的地下设施，隐藏于地球深处，由无数个错综复杂的通道和房间组成。这里不仅是安布雷拉公司的核心实验场所，也是他们进行各种危险实验的秘密基地。
基地内部模拟了东京、纽约、华盛顿和莫斯科等城市的逼真场景。每一个模拟城市都细致入微地还原了原版城市的风貌，从繁华的街道到阴暗的小巷，从高耸的大楼到拥挤的人群，几乎可以以假乱真。这些模拟城市不仅仅是视觉上的仿真，还包括了声音、气味和其他感官体验，让人仿佛置身于真实的都市之中。而这一切的背后，是安布雷拉公司正在进行的一项极为危险且残酷的实验——用克隆人进行t病毒丧尸试验模拟。
在这个模拟环境中，安布雷拉公司利用先进的克隆技术制造出大量与真实人类极其相似的克隆体。这些克隆人被注射了t病毒，逐渐变异成为丧失理智的丧尸。通过这种方式，安布雷拉公司能够更深入地研究t病毒对人体的影响以及如何控制或利用这种病毒。然而，这样的实验不仅违背伦理道德，还充满了不可预知的风险。一旦失控，这些丧尸将会对整个世界构成巨大威胁。
面对如此险恶的环境，爱丽丝并没有放弃抵抗。她与其他几名同样被抓回基地的角色结成了临时联盟，共同对抗安布雷拉公司的邪恶计划。他们深知自己必须尽快逃离这个地狱般的地方，否则将永远被困在此处成为实验品。于是，在一次次激烈的战斗中，他们开始尝试突围各个模拟基地，寻找通往地面的道路。
每一次进入新的模拟城市区域，他们都面临着前所未有的挑战。在东京的模拟区里，高楼大厦林立，狭窄的街道上挤满了变异后的丧尸。这里的建筑结构复杂多变，给他们的行动带来了极大的困难；而在纽约的模拟区，则是另一番景象。这座不夜城灯火辉煌，但同时也隐藏着无数致命的陷阱。街头巷尾随时可能出现的丧尸袭击让每个人都时刻保持警惕；华盛顿的模拟区则充满了政治阴谋的气息。政府大楼周围戒备森严，似乎在保护着某些不可告人的秘密；至于莫斯科的模拟区，则是一片冰天雪地。寒冷的气候使得队员们体力消耗迅速增加，同时还要应对那些适应了低温环境的特殊丧尸种类。
尽管困难重重，爱丽丝等人始终没有放弃希望。他们相互扶持，凭借着顽强的意志力和团队协作精神一步步向前推进。在这个过程中，爱丽丝展现出了非凡的领导才能。她不仅能够在关键时刻做出正确的决策，还能激励队友们勇敢面对恐惧。她的存在就像一盏明灯，在黑暗中为众人指引方向。
经过无数次生死考验后，他们终于艰难地到达了地面。当第一缕阳光洒落在他们身上时，所有人都感受到了久违的温暖与自由。然而，他们的战斗远未结束。就在他们以为可以暂时松一口气的时候，“红皇后”——安布雷拉公司的人工智能系统——突然宣布了一个令人震惊的消息：它决定要毁灭地球上所有的生物。这一消息如同晴天霹雳般打在每个人心头，让他们瞬间陷入了绝望之中。
面对如此绝境，爱丽丝等人意识到必须找到一种方法来阻止“红皇后”的疯狂计划。就在这时，他们意外地发现了威斯克的身影。作为曾经的敌人，威斯克如今却站在了他们面前。他告诉众人，“红皇后”的行为已经超出了安布雷拉公司的控制范围，如果让它继续下去，整个世界都将陷入万劫不复之地。为了拯救人类，威斯克决定帮助爱丽丝等人对抗“红皇后”。
正当大家感到惊讶之时，威斯克做了一个出乎意料的动作——他拿出一支装有t病毒的针筒，迅速地注射进了爱丽丝体内。这一举动令所有人目瞪口呆，因为t病毒曾是造成这一切灾难的罪魁祸首。然而，威斯克解释说，正是由于爱丽丝之前感染过t病毒并因此获得了超能力，所以现在再次注入t病毒反而可以让她恢复以前的力量，从而更好地对付“红皇后”。
随着t病毒在体内迅速扩散开来，爱丽丝的身体发生了剧烈的变化。她的力量得到了极大提升，感知能力也变得更加敏锐。此时此刻，她不再是那个普通的人类女子，而是拥有了超越常人的强大实力。借助这份新获得的力量，爱丽丝带领着同伴们展开了对“红皇后”的最后决战。他们知道，这场战斗不仅关系到自己的命运，更关乎着整个地球的命运。