辽东地区军队经过整肃，辽东镇、辽东都司花名册编制约人，各地援辽军约16万人，总计花名册编制约24.3万人，实际人数约17万人。
按照军队整肃整编整训条列，约名违法犯罪人员被严厉惩处，原辽东总兵李如柏、李如桢，辽东总兵李光荣，宣府镇援辽总兵刘孔胤，蓟镇援辽总兵李秉诚、朱万良、姜弼，辽东都司指挥使张昌胤、辽东参议李乃兰、开原道佥事韩原善，宁前道佥事王化贞，辽海道佥事阎鸣泰、海盖道佥事康应乾、金复道佥事胡嘉模、广宁兵备副使张凤翼、监军张国儒、梁之垣，辽东参将孙得功、鲍承先、李怀忠、陈官定、安云龙、熊锦、李应诏、杨应宗、李养栋，守备石廷柱、刘泽清、郎绍贞，严正中、顾大训、马雄、孙谭、李茂春、刘定邦、王朝彦、麻承宗、刘世勋、尚志弘、毛凤文、王牧民、刘世勋、陈一元、张良策、高出、韩初命、张慎言、何光先、张士彦、黄进、马光远、王世选、陆国志、石天柱等约1700人被判处绞刑。
抄没家产现银约850万银元，房产、珠宝、古玩字画等资产价值约450万银元，土地约170万亩。
按照军队整肃整编整训条例，各地援辽、辽东镇、辽东都司以及奴儿干都司及其卫所裁撤编制。军产军资由皇家卫队接管，被挪用侵吞的军产军资进行追讨。
剩下约15万人，其中约4万老弱病残以及不愿意继续从军的官兵，发放退伍费遣返原籍或就地安置为民。
甑选整编1个师名青壮，进行为期半年的封闭军事训练和文化学习。其它10万人整编为工程部队加入中华建筑民工大军。
蓟镇援辽总兵李怀信、山海关援辽总兵柴国柱以及赵率教调入皇家军事大学担任教官。
甘肃援辽总兵祁秉忠、侯世禄，山海关援辽总兵刘渠、山西援辽总兵杨宗业，陕西援辽总兵梁仲善以及贺世贤、何可纲、尤世功、尤世威、尤世禄、马科、曹文诏、邓祖禹、陈于王、黄得功、徐国全等辽东地区优秀官兵推荐到皇家军事大学进行半年的封闭进修学习。
辽东地区成立皇家卫队东北军区，总部沈阳，由皇家卫队总参谋部直接管辖指挥。熊廷弼担任东北军区总指挥，康实忠担任政治委员，伍实君担任参谋长。
东北军区暂编20个师24万人，负责辽东防务，首要任务防御女真。战略目标剑指整个东北，收复辽东都司、奴儿干都司、朵颜三卫失地，进而征服东西伯利亚、朝鲜半岛、日本。
东北军区当前的主要军事任务为维护辖区的稳定，积极开展全军大练兵，进行严格的军事训练，为未来的大战厉兵秣马。
对外采取稳健的防御战略，实行收缩防御战略，集中兵力驻守辽阳、沈阳、广宁、奉集堡、虎皮驿等战略要地。
严格执行只许据城防守，不许进攻的命令。未经命令，擅自出战者，杀无赦。两年内，辽东地区以守为主，能够守住辽沈就是大功。
通过辽东军队的整肃，彻查泰昌皇帝发放的300万银元辽饷的实际支付情况，掌握贪没证据，配合查处京城参与贪腐辽饷的官员。
北直隶、辽东、山西、西北四地军队花名册编制总计约154万人，实际人数约91万人。违法犯罪人员约9.1万人，遣返原籍或就地安置为民的官兵约24万人，工程部队整编49万人，皇家卫队整编6个师人。
抄没家产现银约4550万银元，房产、珠宝、古玩字画等资产价值约2400万银元，土地约910万亩。
李如柏字子贞，出生于1553年，李成梁第二子。凭借父荫，起家锦衣千户。历任铁岭卫都指挥佥事、密云游击、黄花岭参将、蓟镇副总兵、辽东总兵。
参加萨尔浒之战，兵败逃回北京。天启元年被弹劾，无法承受世人非议自杀。
李如桢，出生于1556年，李成梁第三子。凭借父荫，成为锦衣卫指挥使，执掌南、北镇抚司。萨尔浒之战后，辽东危在旦夕，李如桢被举荐为辽东总兵。铁岭失陷后被罢官。
王化贞字肖乾，万历41年进士，历任户部主事、右参议、辽东巡抚，东林党重要成员。因为党争，王化贞被推到辽东巡抚任上，造成广宁兵败。
阎鸣泰出生于1572年，万历26年进士。历任户部主事、辽东参政、佥事、山东参政、辽东监军、参议、山东按察使司副使、兼右佥都御史、辽东巡抚。
天启5年，担任兵部右侍郎，署协理京营戎政、整饬蓟镇等处边备。天启6年，担任顺天巡抚、蓟辽总督，并任兵部尚书、授太子太保、太子太傅、太子太师。天启7年，授少师。
阎鸣泰实无才略，工谄佞，以虚词罔上而已。阎鸣泰由魏忠贤再起，专事谄谀。每陈边事，必颂功德，于蓟、辽建生祠，多至七所。
张凤翼万历41年进士。历任户部主事、广宁兵备副使。天启初，起右参政，饬遵化兵备。天启6年，巡抚保定。
天启7年任右都御史兼兵部右侍郎。崇祯3年代刘策总督蓟、辽、保定军务，进太子少保、兵部尚书。崇祯9年，女真兵临京城，日服大黄自尽。
刘泽清字鹤洲，山东曹州人。出身行伍，历任辽东宁远、前卫防备、山东都司佥书、副总兵、山东总兵。
甲申国变后，在江南拥立福王朱由崧登基，被封为东平伯，与高杰、刘良佐、黄得功并称为江北四镇。八旗南下，刘泽清率部投降。
刘泽清为人阴狠残毒、睚眦必报、反复无常，被八旗绞死。
李怀信出生于1562年，山西大同人。世袭都指挥佥事，历任山西都司指挥使、延绥参将、定边副总兵、甘肃副总兵、甘肃总兵、蓟州镇总兵。
萨尔浒之战后，受诏援辽，与柴国柱、贺世贤驻守沈阳。林丹汗寇边，与柴国柱回师救援。因与熊廷弼不睦，称病辞职。天启2年，担任大同总兵镇守大同。
李怀信勤政廉洁，有勇有谋，屡平边患，延绥人为立生祠。
柴国柱字擎霄，出生于1568年，世袭西宁守备。历任凉州副总兵、陕西、甘肃、山海关总兵。萨尔浒之战后，受诏援辽。柴国柱骁猛善射、勇冠全军。
赵率教出生于1569年，字希龙，陕西靖虏卫人，万历19年武进士。历任甘州都司、总兵、左都督、平辽将军。崇祯2年在保卫北京的战斗中壮烈殉国。
赵率教廉洁、勇猛，待人厚道，勤身奉公，劳而不懈，和满桂一起被人看作良将。赵率教、满桂死后，辽东战事再无忠勇大将。
祁秉忠出生于1673年，西宁土司，元代甘肃右丞朵儿只失结第九代孙。历任西宁同知、洪水游击、镇海游击、甘肃参将、永昌卫参将、凉州副总兵、甘肃总兵。
天启2年与女真交战时英勇殉国。
侯世禄出生于1678年，由世职累官凉州副总兵。萨尔浒之战后率兵援辽。多次与女真大战受重伤。崇祯16年，李自成攻打榆林。侯世禄死守榆林，城破后被被农民军处死
贺世贤出生于1585年，陕西榆林卫人。从军之后颇有功勋，历任沈阳游击，迁义州参将。万历47年，沈阳保卫战中兵败阵亡。贺世贤有勇无谋，爱好饮酒。
何可纲出生于1590年，有勇有谋，廉洁勤政，辽东猛将。崇祯4年被祖大寿投降时杀害。何可纲面不改色，含笑而死。
尤世功出生于1594年，万历时期武举人；尤世威出生于1596年；尤世禄出生于1598年，天启2年武进士。天启元年，女真破沈阳，尤世功战死。
崇祯16年，尤世威、尤世禄两兄弟与李自成决战七昼夜，榆林城破，至死不降，兵败被杀。三兄弟以作战勇敢着称，一生南征北战，壮烈殉国，满门忠烈。
马科出生于1600年，西宁人，以偏裨平流寇积功至总兵。以敢战着称，战功仅次于曹变蛟。北京失陷后降于李自成，大顺军失败后又投降八旗。
曹文诏出生于1595年，山西大同人。初从军辽东，先后隶随熊廷弼、孙承宗，积战功历任游击将军、参将、延绥副总兵、临洮总兵、山西总兵、大同总兵。
与李自成农民军作战陷入重围，兵败自杀。曹文诏有勇有谋，忠诚为国，号称明末第一良将。
邓祖禹出生于1595年，湖北黄冈人，万历47年武进士，历任沈阳守备、宣府守备、涿州副总兵。与农民军作战，战败殉国。
陈于王字丹衷，出生于1595年，南直隶苏州人。世袭苏州卫千户，乡试武举。授奇兵营守备，以捕获海盗战功，迁都司佥书，守崇明蛇山。率战舰生擒海盗王一爵，全歼其党羽。
熊廷弼担任辽东经略时用为参将。崇祯时，与农民军作战，战败殉国。
黄得功字虎山，出生于1600年，军中号黄闯子，辽东开原人。历任辽东游击、京营副总兵、总兵。
甲申国变后，在江南拥立福王朱由崧登基，被封为靖南伯，与高杰、刘良佐、刘泽清并称为江北四镇。八旗南下，战败后自杀殉国。
徐国全出生于1595年，泰昌元年武状元。任辽东都司佥书，辽阳失陷，自杀殉国。