暑期讲座已经接近了尾声，透过许许多多的课程与各式各样的宝可梦接触交流，对彼此敞开心扉，现在山梨博士终于要发表最后的课程内容了。
山梨博士的声音透过广播传来，道：“最后的课程是暑期讲座里最大的一场活动，宝可梦铁人三项！希望大家活用在这里学到以及体验到的事情，在比赛当中全力以赴！”
接下来就是导师讲解规则，道：\"出发地就是研究所，全体学员都是同时出发。到达指定地点后，去拿我们准备好的精灵球，但是大家没有办法确定里面的宝可梦。你们要和宝可梦一起，穿过森林到湖泊旁拿下一个精灵球，用水系宝可梦穿过湖泊后，最后就是和自己持有的一只宝可梦，用马拉松的方式回到研究所。\"
小光道：“跟第一天的课程内容是一样的。”
“此外要注意，绝对不可以在竞赛的过程中攻击其他的选手以及宝可梦。第一名会得到50分，第二名是30分，第三名是20分，从第四名到达的选手开始，将每人都会得到十分，然后所获得的分数总和就是每组最后的成绩。”
规则全都讲清楚后，所有参加暑期讲座的成员都聚集在研究所前的空地上，他们的脚下正是起跑线。
小葵道：“我们红组要夺得前三名，继续保持我们的领先地位。”
小光道：“对啊，我也会努力的！”
“嘿嘿嘿，在这一周内我得到了小光小姐有关的所有数据资料，并且已经分析完毕了。原因就是，在今天的宝可梦铁人三项中，我认为你将会是我最大的劲敌。我会彻底锁定你的一举一动的，所以就请好好期待吧！”考平幽灵般的身影出现在小光的身后，让小光背后一凉。
考平说完就走了，小光仍旧一脸懵，道：“他......到底想要做什么？”
小刚无奈道：“考平这个人还真的是不能以常理推断的人。”
山梨博士带着乔伊小姐来到了空地处，山梨博士道：“各位，看来你们已经迫不及待了！”
乔伊小姐笑着跟大家打招呼道：“大家好，接下来各位的身体健康以及宝可梦们的状态就都交给我吧！”
小刚花痴道：“美丽的乔伊小姐正为了我在一旁待命，光是听到这件事，小生的心就已经怦怦跳，身体就开始不舒服了，拜托请立刻为我治疗吧......麻掉了，麻了！”
不良蛙出现，给了小刚一记毒刺，小刚当即就失去了战斗能力！就不知道比赛的时候能不能恢复了，不过小智他们还是低估了小刚的恢复能力。
十分钟后，山梨博士宣布道：“现在宝可梦铁人三项即将开始，全体各自就位！”
所有人在起跑线准备就绪。
“预备！！”
“砰！”
随着一声枪响，暑期讲座的最后的铁人三项比赛正式开始，武藏一马当先冲到了最前面，喊道：“快让开，快让开！武藏琳达大人要通过了咧！”
第一个据点也是武藏先到达，武藏拿了一个精灵球，道：“我是第一个到的咧，快出来吧！”武藏得到的是河马兽，武藏不干了，摆摆手道：“讨厌了，是河马兽！退货退货，武藏琳达我喜欢更帅气一点，跑得更快的咧，我要换......”
武藏当然是被拒绝了，小智他们第二集团已经到了。武藏只好骑上了河马兽，但河马兽不是用跑的而是钻入了地下前进。
小智拿到了噗噗猪，小葵拿到了阿利多斯，小光拿到了嘟嘟利，小刚拿到了大岩蛇，四人包揽了第一名到第四名的名次。
很快小智以第一名的优势率先赶到了湖泊，他将手里的宝可梦进行了更换，下一只宝可梦是巨翅飞鱼。第二名的小葵用的是乘龙，用出了急冻光线踏冰前进，拉开了与小刚和小光的距离，但距离小智的距离还有一些。第三名和第四名的小光和小刚使用的是巨牙鲨和大力鳄，看着前面领先的两人，无奈一笑。
考平采用的是浮潜鼬的潜水战略，超过了第三名的小光。武藏这边从河马兽换成了鲤鱼王，鲤鱼王的蹦跶也不是普通野生的鲤鱼王能比的，带着武藏来到了第一的位置。
通过湖泊后，就是开启了马拉松。小智本来肩膀上就带着皮卡丘，现在皮卡丘跳下小智的肩膀与他一同奔跑，小智的奔跑速度本就极快，进行马拉松后就开始加速。小智不出所料的夺得了冠军，得到了50分的积分。
小葵得到了第二名，获得了30分的积分。小刚获得了第三名，小光第四名。但是考平和武藏却因为体力不支，前期冲的太快，后期的体力完全不行，最后包揽了倒数第二和倒数第一。结果就是红组以绝对的优势，拿下了第一名！
暑期讲座的最后一项课程结束，山梨博士给每个参加的学员颁发了一个纪念证书，山梨博士道：“所有的课程到此结束，首先祝贺获得优胜的红组的学员，蓝组与绿组的学员也很优秀。希望从今以后，大家也能各自与宝可梦亲近、学习，结交更多的朋友，并且加深彼此的友情。”
“好了，接下来就是篝火晚会了！”
夜幕降临，炙热的篝火燃烧着，晚餐也很是丰富，在这七天中交到的朋友们在篝火下告别，交换联系方式，等待着下一次的重逢。小次郎和喵喵作为工读生这次也拿到了丰厚的薪水，以至于忘记这些天究竟是要来干什么的了。
翌日，众人纷纷与山梨博士告别，分别踏上了他们各自的旅程，小智三人也与小葵约定，返回到随意镇的时候，要到她家的培育屋去做客。
在宝可梦暑期讲座度过七天快乐生活的小智三人，他们接下来的目的地是到神和镇参加即将举办的华丽大赛。