前往绿岭市的途中，因为火箭队的关系，小智等人落入了海中，火箭队也被皮卡丘的十万伏特打飞。
小智和小胜坐在了乘龙的背上，水箭龟托着小遥与小刚在海里漂流。
小遥抱怨道：“要不是火箭队我们怎么会被爆炸的反作用力打到海里！小智现在怎么办啊！”
小智道：“只能让找找路希望能到附近的岛上，再想办法了。乘龙走吧！”
这时，海面不平静起来，巨大的浪朝小智他们袭来，脚下似乎踩到了什么实体的东西，一行人被托起到了海面上。众人这才发现踩在了一艘红色的潜水艇上，小智将乘龙和水箭龟收回精灵球。
小遥兴奋道：“看样子我们得救了！是潜水艇哎！”
小刚道：“说不定能让潜水艇里的人把我们带到附近的小岛上。”
小智阻止道：“先等等，这红色的潜水艇，还有这标志，是火岩队的潜水艇。”
“什么？”小刚三人震惊之余，看了看标志，还真的是。
小智带着三人藏了起来，他们的视线正好能看到火村。火村拿着望远镜问手下道：“声纳没有任何反应是吗？”
火岩队队员道：“是的，似乎并不在这片海域。”
火村将手里的望远镜交给手下，道：“我知道了！”
小遥低声道：“还真是火岩队！”
小刚苦笑道：“我们的运气真的太好了，这样的都能遇到火岩队。”
小胜道：“你们看，好像是火岩队的秘密基地。”
海面上一座耀眼的红色建筑，出现在小智等人面前。
小刚道：“这样我们迟早被发现！”
小智道：“也没有地方躲了，发现就被发现吧！我们又不是没有一战的能力，逃跑也是没问题的。”
想到小智拥有的神兽，三人也似是找到了点心理安慰，也变得从容了起来。
潜水艇进入了火岩队的秘密基地，潜水艇停下后，火村道：“报告老大，第三行动队的巡逻任务已经执行完毕！”
火村对面的这个中年人也看到了小智等人，小智也就大大方方的走了出来，挡在三人身前。火村惊讶道：“小鬼居然是你！你怎么到火岩队的潜水艇上的？老大，这就是我跟您说过的那个破坏我们计划的小鬼。”
小智朝火村打招呼道：“好久不见了，你的大狼犬强一点了没有，别这么不经打！”
火村怒道：“小鬼！”
火村被小智激怒，想要拿出大狼犬跟小智的皮卡丘在对战一次，但被那个中年人拦了下来，他朝小智道：“没想到联盟的特别搜官竟然是这么年轻的孩子！我叫赤焰松火岩队的老大。”
小智大方一笑：“跟你的手下交手了好几次，但是见到火岩队的老大还是第一次。”
赤焰松也哈哈一笑道：“嘴皮子也挺能说啊！不过我可不是火村不会被你的三言两语就激怒。我也没有意思想要加害你们，只是我现在很忙，在这次的作战计划结束前，请你们就留在潜水艇上吧！”
就在这时候一个身穿火岩队制服的女人跳出了潜艇，这和火岩队不同的波导感觉当然没有逃过小智的感知，但还有一个更加熟悉的波导。小智给空间里的梦幻打了一个招呼，就继续和火村对话道。
火村对小智的实力很是忌惮，向赤焰松提醒道：“老大，这个小鬼的皮卡丘太强了！”赤焰松并没有将小智放在眼里，道：“无所谓了！倒是水舰队的动向如何？”
火村道：“他们应该就潜航在这个附近，在目前这个时间点梦斯岛近海并没有办法得到确认。”
赤焰松略作思考道：“我知道了！”
此时超古代宝可梦盖欧卡已经被水舰队的泉美打倒守卫找到了，盖欧卡被火岩队的机器强行进入了睡眠。泉美看着盖欧卡道：“盖欧卡，我现在就放你自由！”
泉美输入了密码解开了束缚住盖欧卡的机器，盖欧卡即将被唤醒！
小智四人被赤焰松带到了他的办公室，以胜利者的姿态，笑道：“你们都坐下来吧！这样站着实在很难跟你们谈话。”
小智看着把他们团团围住的火岩队队员，也不抵抗拉着三人坐了下来，道：“要谈话，没有水或者饮料吗？这样口干怎么办？”
赤焰松道：“事到如今，小智搜查官还这么坦然，我真的很欣赏你！去安排饮料吧！只要你敢喝就有。”
小智笑道：“当然敢，到现在都没有喝水早就口渴了。”
不一会儿，火岩队的队员就端上来了四杯饮料。小遥和小胜被大狼犬凶恶的表情瞪的有些背后发凉，局促不安地坐着。小智先拿过了一杯饮料喝了一口，朝小刚点了点头，小刚也才拿起来喝了一口。
小智重新放下杯子，这才道：“你想要跟我谈什么呢？”
赤焰松道：“相信你对我们火岩队要做的事情稍微有点了解吧！”
小智笑道：“当然了解了，你们火岩队的目的是固拉多，而水舰队的目的是盖欧卡，虽然你们关系差，但是本质的目的是一样的。”
赤焰松道：“你好像对我们有点误会，我们火岩队设立的目的是为了解开这个星球的谜题，为了创造更美好的世界。跟水舰队那些流氓无赖的集团完全不一样。”
说得好听，根本没区别好吧！
小刚道：“不管怎么样，朝古代宝可梦都只是传说，没有这么容易就找到的。”小刚话才出口，就想起了小智空间中的那一堆神兽，哪个不是传说中的。
谁的运气都没有小智这么好的，但对于普通的训练家来说一辈子都不可能遇到一只神兽，当然只是传说了！
赤焰松不以为然道：“不好意思！超古代宝可梦之一的盖欧卡已经在我们的手中了。而且，还有这个可以控制固拉多的蓝色之珠。“
小智早就用波导之力感应到了，火岩队的这个秘密基地的最下面关着的是盖欧卡，但眼前的这颗蓝色之珠他亲眼看到了后才确定这并不是真正的靛蓝色宝珠，赤焰松和水桐梧曲解了这段历史，蓝色之珠和红色之珠只能唤醒双方，但不是完全的控制，双方一旦苏醒，就会让两只都陷入狂怒状态，珠子也就没有用了，这才有了历史中的固拉多与盖欧卡的超古代战争。
小智没有赤焰松意料之中的反应，难道他早就知道了？
但赤焰松仔细一想觉得又不可能，小智要有这个能力早就从这里逃跑了！